رهبر انقلاب اسلامی در پی حضور پرشکوه و حماسی مردم در انتخابات ۲۹ اردیبهشت‌ماه پیام تشکر و قدردانی صادر، و در ادامه به نکات مهمی تأکید کردند.
ایشان در بخشی از این پیام خطاب به دولت دوازدهم مرقوم کردند: «به رئیس‌جمهور محترم و همه‌ی کسانی که در دولت آینده شرکت خواهند داشت سفارش و تأکید میکنم که کار و تلاش پرانگیزه و اندیشیده و جوانانه را برای برطرف کردن مشکلات کشور در پیش گیرند و لحظه‌ئی از این خط مستقیم غفلت نکنند.
رعایت قشرهای ضعیف، توجه به روستاها و مناطق فقیر، در نظر گرفتن اولویتها، برخورد با فساد و با آسیبهای اجتماعی، باید در صدر برنامه‌ها قرار گیرد.»؛ «عزت ملّی و رعایت حکمت در ارتباطات جهانی و اهتمام به اقتدار بین‌المللی نیز از جمله‌ی اولویتهای مدیریت انقلابی و اسلامی است.»